Ministrul suspendat al Apărării, Teodor Atanasiu, susţine că preşedintele Traian Băsescu i-a atribuit afirmaţii pe care nu le-a făcut niciodată, cum este aceea că ar fi numit armata “un muşuroi de furnici". "Eu m-am referit doar la grupurile de interese care roiau în jurul Ministerului Apărării. Am deranjat un grup de generali şi ofiţeri superiori din cadrul Armatei, care, potrivit procurorilor şi controalelor de audit, au confundat bugetul instituţiei cu propriul buzunar", a afirmat Atanasiu într-un comunicat de presă, precizînd că nu ştie dacă cei vizaţi de anchetele penale sînt vinovaţi şi că acest lucru urmează să fie decis de justiţie, nu de Traian Băsescu. "Recentele declaraţii ale preşedintelui îmi confirmă ideea că la Palatul Cotroceni mi-a fost «fabricat» un dosar politic, că sînt o ţintă politică şi victima unui abuz, pentru simplu motiv că nu m-am făcut preş în faţa preşedintelui şi am propus retragerea trupelor româneşti din Irak", a subliniat Atanasiu în comunicat. El a opinat, de asemenea, că dosarul pe care l-a cerut şi l-a primit de la Comisia prezidenţială este încă o dovadă că a fost găsit vinovat de Palatul Cotroceni înainte ca măcar să fie judecat. "Dosarul nu conţine nici o dovadă care să mă incrimineze şi îl invit pe dl. preşedinte să facă public acest dosar", a continuat el. Atanasiu a mai spus că această convingere i-a fost întărită de "uluitoarea declaraţie" a consilierului prezidenţial Theodor Stolojan, care a spus presei că, dacă şi-ar fi cerut iertare, cazul ar fi fost închis. "Este cea mai evidentă dovadă că suspendarea mea s-a făcut pentru delict de opinie şi nu pentru că aş fi săvîrşit vreo infracţiune", a adaugat el.

Potrivit ministrului suspendat al Apărării, atunci cînd preşedintele Băsescu a fost la rîndul său “client” al Comisiei prezidenţiale în dosarul “Flota”, a declarat că această comisie trebuie desfiinţată şi că încercarea de responsabilizare a unui ministru i se pare ridicolă. "A spus tot atunci că i s-a întocmit un dosar pe bază de sugestii. Acum, s-a transformat în acuzator şi judecător, utilizînd instrumente moştenite şi dovedind că judecă aceleaşi fapte după interesul personal", a conchis Atanasiu.