Administraţia Obama ar putea publica o serie de documente despre politici controversate ale fostei administraţii republicane, inclusiv despre închisorile secrete ale CIA, deşi sînt şanse mici să fie dezvăluite ţările care au găzduit astfel de centre. Printre primele decizii luate de Barack Obama în calitatea de preşedinte se numără renunţarea la programul închisorilor secrete CIA. Cu toate acestea, CIA şi Departamentul de Stat probabil vor refuza să confirme oficial ţările în care au existat astfel de închisori. În cazul politizării activităţilor Departamentului Justiţiei prin demiterea unor procurori federali în 2007, ar putea fi audiat Karl Rove în Congres, deşi, probabil, fostul consilier de la Casa Albă ar putea refuza să răspundă la unele întrebări. Un alt program controversat este cel privind interceptarea convorbirilor telefonice şi mesajelor electronice fără mandat din partea justiţiei. Barack Obama a criticat programul în campania electorală, dar ulterior a votat în favoarea unui proiect care protejează firmele de telefonie mobilă de acţiuni în justiţie. Este foarte probabil ca administraţia Obama să menţină secretul asupra acestui program controversat.

De asemenea, administraţia democrată ar putea publica stenogramele audierilor lui George W. Bush şi Dick Cheney în cazul dezvăluirii identităţii agentului CIA Valerie Plame. În cazul celor 40 de reglementări ale Departamentului Justiţiei pe tema tehnicilor dure de interogare, este foarte probabil să fie prezentate majoritatea documentelor, deşi despre unele tehnici speciale de interogare s-ar putea să nu se afle niciodată.