Războiul civil din Siria riscă să aducă o confruntare directă între Iran și Israel, ceea ce ar destabiliza întreaga zonă din Orientul Mijlociu. Generalul Mohammad Baqeri, şeful Statului Major al Iranului, a anunțat că Teheranul nu va tolera încălcarea spaţiului aerian şi teritoriului sirian de către forţele israeliene. "Nu este acceptabil ca regimul zionist să încalce teritoriul Siriei oricând vrea asta", a declarat Baqeri cu ocazia unei vizite întreprinse la Damasc. Generalul iranian a discutat cu oficialii militari sirieni despre cooperarea împotriva "inamicilor comuni, zioniştii şi teroriştii", referindu-se la Israel şi miliţiile sunnite din Siria.
Începând din 2012, Iranul şiit a oferit sprijin militar regimului preşedintelui Bashar al-Assad, care se confruntă cu forţele opoziţiei şi militanţii sunniţi. Mişcarea islamistă libaneză Hezbollah, susţinută de Iran, a jucat un rol major de partea lui Assad în conflictul civil din Siria. Israelul a comunicat că în ultimii cinci ani a atacat de aproape o sută de ori convoaie de transport arme către Hezbollah, unul dintre principalii inamici ai Israelului, care este activ în sudul Libanului.