La mai puţin de două săptămâni după ce Katie Holmes anunţa că a deschis o acţiune de divorţ, ea şi Tom Cruise au convenit asupra detaliilor despărţirii şi au semnat o înţelegere de divorţ, astfel încât lucrurile să se deruleze cât mai rapid în instanţă iar mariajul lor să poată fi desfăcut. Actriţa Katie Holmes a solicitat divorţul la 28 iunie, invocând divergenţe ireconciliabile. Aceasta a solicitat custodia deplină a fetiţei lor, Suri, de 6 ani. ”Suntem hotărâţi să conlucrăm, în calitate de părinţi, în interesul fiicei noastre Suri. Ne dorim ca problemele care privesc familia noastră să rămână private”, se arată într-un comunicat semnat de Katie Holmes şi Tom Cruise. Detaliile financiare ale acordului semnat sunt, după câte se pare, protejate prin clauze de confidenţialitate draconice, mai ales că Tom Cruise face parte dintre actorii cei mai influenţi şi mai bine plătiţi de la Hollywood. Site-ul TMZ.com, specializat în postarea de informaţii despre celebrităţi, anunţa însă că ”acest document extrem de complicat a încredinţat actriţei Katie Holmes custodia principală asupra micuţei Suri, în timp ce Tom Cruise va beneficia de drepturi generoase de vizită”. Acordul include şi restricţii, în cazul în care fiica lor va fi iniţiată în chestiuni religioase, inclusiv în scientologie. Aparent, Tom Cruise a renunţat foarte uşor la custodia fiicei sale dar a impus o singură condiţie: să o poată vedea oricând îşi va dori. În plus, intimitatea sa pare să fie mai importantă decât propriul copil.

MOTIVE NECLARE Multe voci susţin că această relaţie s-a răcit din cauza diferitelor contracte de filmare obţinute de Tom Cruise şi a faptului că mari perioade de timp din an nu erau împreună. Alte voci pun totul pe seama religiei lui Tom Cruise, scientologia, în care Katie Holmes nu ar fi putut să se integreze. Deocamdată, cei doi rămân discreţi în privinţa rolului jucat de cultul scientologic în eşecul mariajului lor. Potrivit presei americane, rolul cultului scientologic în educaţia micuţei Suri s-ar afla la originea procedurii de divorţ lansate de Katie Holmes, care se teme ca această congregaţie să nu o considere, de acum înainte, o ameninţare şi să înceapă să o urmărească şi să o supravegheze.

Relaţia celor doi, botezaţi de presă TomKat, care au avut o luxoasă nuntă organizată la un castel italian, în noiembrie 2006, oficiată în rit scientologic, a fost urmărită îndeaproape de media, încă de la începuturi, din 2005. Pe atunci, Katie Holmes era o actriţă în ascensiune la Hollywood, fiind cunoscută pentru rolul din serialul de televiziune ”Dawson\'s Creek”. Pentru Tom Cruise, cu 16 ani mai în vârstă, acesta este cel de-al treilea divorţ. Actorul a fost căsătorit în trecut cu actriţele Mimi Rogers, între anii 1987-1990 şi cu Nicole Kidman, între anii 1990 - 2001. Cuplul Nicole Kidman – Tom Cruise a adoptat doi copii, pe Isabella, acum în vârstă de 19 ani şi pe Connor, de 17 ani. Aceşti copii au fost crescuţi în cultul scientologic, după divorţul de Nicole Kidman.