Metodologia de organizare a examenului de rezidenţiat a fost modificată în sensul stabilirii unei tematici comune pentru toate grupele de specialităţi din profilul medicină, spre deosebire de anii trecuţi cînd examenul de rezidenţiat era organizat pe grupe de specialităţi. Preşedintele comisiei ce va organiza examenul de rezidenţiat în 2007, conf. dr. Corin Bădiu, a declarat că s-a stabilit pentru anul acesta, un examen cu trunchi comun pentru patru grupe diferite: medicină de laborator, medicină de familie, medicină chirurgicală şi specialităţi medicale. De asemenea, tematica şi bibliografia pentru examen vor fi comune pentru aceste grupe medicale. Bădiu a precizat că grupele medicină dentară şi farmacie vor da examenul separat, ca şi pînă acum.

Pînă în anul 2006, rezidenţiatul pe profilul medicină a fost organizat la nivel naţional, separat pentru grupa specialităţi medicale şi medicină de familie, grupa de specialităţi chirugicale şi grupa medicină de laborator, iar tematica fiecărei grupe de specialităţi era diferită şi în concordanţă cu specificul fiecărei grupe de specialităţi. Motivul pentru care s-a decis această schimbare a metodologiei examenului de rezidenţiat pentru anul 2007 este acela că bibliografia trebuia revizuită şi că absolvenţii de medicină ar trebui să deţină un nivel crescut de cunoştinţe, atît din domeniul specialităţilor medicale, cît şi din specialităţile chirurgicale. Studenţii din anul terminal de la facultăţile de medicină au cerut însă, printr-o scrisoare, la începutul lunii martie, ca modificările ce privesc metodologia desfăşurării examenului de rezidenţiat să nu se aplice deoarece decizia a fost pripită şi insuficient dezbătută. Mai mult, studenţii au cerut dezbateri publice, transparente, în privinţa introducerii trunchiului comun. Ei au argumentat în respectiva scrisoare, că specializarea medicilor este de preferat deoarece aceştia nu pot acoperi toată medicina umană, în condiţiile în care evoluţia tehnologiilor şi tehnicilor de tratament obligă la specializare şi chiar supraspecializare. Totodată, au susţinut că introducerea unui trunchi comun ar duce la crearea unei tematici „hibrid” care nu va produce o reformă a învăţământului medical şi au arătat că schimbarea trebuia anunţată cel puţin cu 12 luni înaintea examenului.