Ministerul Afacerilor Externe (MAE) şi ministerul Afacerilor Europene (MAEur) şi-au trasat, într-un protocol, sarcinile care revin fiecărei instituţii în parte. MAE va avea competenţă exclusivă în ceea ce priveşte prezenţa românească în instituţiile UE şi MAEur va gestiona compatibilitatea legislaţiei naţionale cu cea a UE, însă cele două ministere urmează să împartă responsabilităţile în ceea ce priveşte Mecanismul de Cooperare şi Verificare şi aderarea la Schengen. Prevederile sunt incluse în anexa Protocolului de cooperare între MAE şi MAEur, al cărui text a fost publicat luni de Ministerul Afacerilor Europene. Protocolul conţine şi o anexă în care sunt înscrise domeniile de competenţă exclusivă ale fiecăruia dintre cele două ministere, precum şi cele de competenţe partajate.