Aderarea României la UE presupune şi adoptarea reglementărilor europene privind TVA, care prevăd, printre altele, introducerea noţiunilor de livrare şi achiziţie intracomunitară, noi raportări şi eliminarea facturilor cu regim special, prevederi incluse în Codul Fiscal. În UE nu există bariere vamale între statele membre, astfel că este necesară aplicarea aceloraşi reguli fiscale, legislaţia armonizată privind TVA fiind baza legală pentru calcularea contribuţiei României la bugetul comunitar. În cazul comerţului cu bunuri, controlul vamal va fi eliminat, iar noţiunile de import şi export vor fi înlocuite cu cele de achiziţie intracomunitară, respectiv livrare intracomunitară. Controlul mişcării bunurilor între ţările UE va fi realizat prin intermediul sistemului electronic VIES - VAT International Exchange System, prin care statele membre vor face schimb de informaţii şi controale multilaterale în scopul evitării fraudei fiscale în domeniul TVA. România va implementa obligativitatea depunerii de declaraţii recapitulative trimestriale pentru livrările intracomunitare realizate, precum şi pentru achiziţiile intracomunitare de bunuri, în locul declaraţiilor de import/export, informaţii care vor fi transferate în VIES. De asemenea, lunar, se vor întocmi declaraţii Intrastat pentru bunurile care intră din UE în România, dacă valoarea depăşeşte 85.000 de euro, şi pentru bunurile care ies din România, în cazul în care nivelul este superior sumei de 250.000 de euro. Totodată, vor apărea noi documente de organizare a evidenţei fiscale pentru operaţiunile din sfera TVA, cum ar fi jurnalul de vînzare, de cumpărare, registrul non-transferurilor, registrul bunurilor de capital şi registrul bunurilor primite. Totodată, firmele vor avea posibilitatea să aplice scutirea de TVA pentru o livrare intracomunitară, în funcţie de documentele pe care le prezintă pentru a justifica această scutire. Pentru achiziţiile intracomunitare, operatorii economici înregistraţi în scopuri de TVA nu vor face plata efectivă, ci vor aplica taxare inversă, respectiv plata prin decontul de TVA. Pe lîngă operaţiunile obişnuite privind livrările şi achiziţiile intracomunitare, vor exista reglementări speciale pentru bunurile care fac obiectul contractelor de consignaţie, bunurile puse la dispoziţia clientului, bunurile transmise în vederea verificării conformităţii, pentru testare, pentru probe, operaţiuni triunghiulare, care implică firme din trei state membre diferite, bunuri care fac obiectul unor măsuri de simplificare. De la data aderării se abrogă legislaţia privind factura fiscală cu regim special, întrucît, prin eliminarea barierelor vamale, mărfurile vor circula însoţite de facturi emise de fiecare stat membru, care trebuie recunoscute în statul care realizează achiziţia intracomunitară. Printre modificările Codului Fiscal aprobate de Parlament în luna iulie se numără şi introducerea prevederilor referitoare la facturarea electronică, aplicabile de la data aderării. De asemenea, firmele îşi vor putea personaliza facturile. Companiile care vor deţine în stoc la sfîrşitul anului 2006 facturi fiscale speciale au posibilitatea să le utilizeze şi după data aderării pînă la epuizare. În ceea ce priveşte cotele de TVA se vor menţine şi anul viitor cota standard, de 19%, şi cota redusă, de 9%, pentru intrarea la muzee, expoziţii, cinema, distribuţia de publicaţii, cazare şi medicamente. Legislaţia europeană prevede o limită inferioară a cotei reduse de 5% şi o listă care specifică produsele ce pot fi taxate cu nivelul minim.