Performera ultimului tur al Cupei UEFA-Intertoto este formaţia Maribor Branik, slovenii reuşind să elimine echipa spaniolă Villarreal, semifinalista ediţiei 2005-2006 a Ligii Campionilor. "Submarinul galben" nu a ştiut să piardă, cea mai bună dovadă fiind cele trei eliminări din tabăra spaniolă: Tacchinardi, G. Rodriguez şi D. Forlan. În celelalte partide din manşa secundă a turului al treilea putem spune că s-au înregistrat rezultate scontate, surprizele lipsind, deşi, în unele partide, gazdele erau considerate favorite în urma scorurilor din tur.
Rezultate: FC TWENTE (Olanda) - Kalmar FF (Suedia) 3-1 (Bakircioglu 48, Touma 73, 79/ L. Johansson 66) - în tur: 0-1; Lillestrom (Norvegia) - NEWCASTLE (Anglia) 0-3 (Ameobi 29, 36, Emre 90) - 1-1; Hibernian (Scoţia) - ODENSE (Danemarca) 2-1 (R. Jones 54, P. Dalglish 80/ Grahn 51) - 0-1; KAYSERISPOR (Turcia) - Larissa (Grecia) 2-0 (G. Ünal 32, 81) - 0-0; ACHNAS (Cipru) - Maccabi Petach-Tikva (Israel) 2-3 (Pelic 73, Poyiatzis 79/ Sarsor 31, Galdeira 44, Soufo 83) - 2-0; Dnepr Dnepropetrovsk (Ucraina) - OLYMPIQUE MARSEILLE (Franţa) 2-2 (Nazarenko 78, Rusol 86/ Niang 71, Oruma 76) - 0-0; FC Moscova (Rusia) - HERTHA BERLIN (Germania) 0-2 (Pantelic 25, Basturk 89) - 0-0; FC Farul (România) - AUXERRE (Franţa) 1-0 (D. Todoran 46-pen.) - 1-4; FC Tiraspol (Moldova) - RIED (Austria) 1-1 (Rudac 83/ Damjanovic 29) - 1-3; Gent (Belgia) - GRASSHOPPERS ZURICH (Elveţia) 1-1 (Foley 66/ Ribeiro 64) - 1-2; NK MARIBOR (Slovenia) - Villarreal (Spania) 1-1 (Cipot 89/ Nihat 85) - 2-1.